تؤمن مدرسة عمّان الوطنيّة بأنّ العمل المخبريّ يلبّي رغبة، وحاجة البشريّة في معرفة ماهيّة الأشياء، وكيفيّة عملها، ولماذا وجدت، فالعمل المخبريّ يَسمح للطلبة بتطوير التّعلّم القائم على الاستقصاء، كما يمنح الطّلبة الفرصة لاعتماد المنهج العلميّ كأسلوب تفكير.
يحتوي قسم العلوم على أربعة مختبرات مجهزّة تجهيزًا كاملًا، ويُشرف عليها ثلاثة فنيي مختبرات، لدعم المناهج، ولتلبية متطلبات البرامج الوطنيّة والدّوليّة. يتم شراء أحدث الأدوات، والعيّنات، والأجهزة، واللوحات التعليميّة، وما إلى ذلك بشكل مستمر لهذه المختبرات. وتُستخدم على نطاق واسع للقيام بالمشاريع، والأبحاث، والتحضير لـلمقالات البحثيّة لطلاب البكالوريا الدّوليّة. يقوم المعلمون بجدولة زيارات المختبرات على مدار العام، حيث يخدم أحد المختبرات صفوف الروضة والقسم الابتدائي، بينما تخدم المختبرات الثلاثة الأخرى: (الفيزياء والكيمياء والأحياء) الصفوف من السّادس إلى الثّاني عشر، إضافة إلى ذلك، تم إنشاء مختبر مصغّر للطاقة الكهروضوئيّة للسماح للطلبة بتوسيع أنشطتهم ومشاريعهم المتعلقة بالطاقة الشّمسيّة.
يتوفر أيضا في المدرسة مختبر للروبوت ومختبر لبرنامج "فورميلا ون". جُهّز هذان المختبران لتدريب الطلبة ومشاركة فرق المدرسة في المسابقات الوطنيّة والدّوليّة والتي تشجّع على تطبيق العلوم والتكنولوجيا في بيئة تفاعليّة وإبداعيّة.
